Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccl20O89093 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms