Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sap30O88574 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms