Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops6O88545 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops6O88545 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops6O88545 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cops6O88545 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Cops6O88545 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Cops6O88545 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Cops6O88545 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Cops6O88545 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cops6O88545 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms