Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AurkcO88445 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AurkcO88445 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322 ms