Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
E2f6O54917 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms