Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TsksO54887 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TsksO54887 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TsksO54887 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TsksO54887 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TsksO54887 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TsksO54887 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TsksO54887 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms