Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clk2O35491 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk2O35491 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clk2O35491 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clk2O35491 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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