Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TnxbO35452 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms