Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcc1O35379 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Abcc1O35379 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
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