Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dgcr6O35347 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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