Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Slc18a3O35304 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Slc18a3O35304 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms