Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Casq1O09165 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Casq1O09165 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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