Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LhbO09108 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LhbO09108 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LhbO09108 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LhbO09108 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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