Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snap23O09044 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms