Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NumblO08919 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NumblO08919 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NumblO08919 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NumblO08919 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NumblO08919 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NumblO08919 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NumblO08919 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NumblO08919 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NumblO08919 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms