Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Eftud2O08810 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms