Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vwa3bJ9JI28 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vwa3bJ9JI28 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms