Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8298J3QPI0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8298J3QPI0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8298J3QPI0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8298J3QPI0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm8298J3QPI0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm8298J3QPI0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm8298J3QPI0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm8298J3QPI0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm8298J3QPI0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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