Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm8356J3QPD3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm8356J3QPD3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm8356J3QPD3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms