Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm2035J3QP87 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms