Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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