Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms