Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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