Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn20G5E8X0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn20G5E8X0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn20G5E8X0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn20G5E8X0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn20G5E8X0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms