Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HrcG5E8J6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HrcG5E8J6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms