Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm28038F7BCN9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms