Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8005F6YKY3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms