Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8247F6VRJ8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms