Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm340F6RGI3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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