Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms