Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms