Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms