Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm5478D3Z6R0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5478D3Z6R0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm5478D3Z6R0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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