Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms