Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf217D3YYI7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf217D3YYI7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms