Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms