Protein–RNA interactions for Protein: D3YX03

Gm7849, Predicted gene 7849, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7849D3YX03 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm7849D3YX03 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms