Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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