Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms