Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abcc8B2RUS7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abcc8B2RUS7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms