Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uhrf1bp1B2KF50 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms