Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spocd1B1ASB6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spocd1B1ASB6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms