Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm12A2AJ77 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm12A2AJ77 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm12A2AJ77 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm12A2AJ77 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Prdm12A2AJ77 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prdm12A2AJ77 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Prdm12A2AJ77 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Prdm12A2AJ77 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms