Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34dA2AGU5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34dA2AGU5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms