Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pramef6A2A8M8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pramef6A2A8M8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms