Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm2A2A7B5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms