Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm37154-201ENSMUST00000192266 1290 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms