Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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