Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Knop1Q9Z2Q2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms