Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Uso1Q9Z1Z0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms